主题： 肿瘤纯度估计及相关计算问题
时间🏋🏻♀️：2021年10月8日下午1:00-2:30
地点：腾讯会议（会议号：832805486）
主讲人：郑小琪，上海师范大学数学系教授，博士生导师。主要从事生物统计和生物信息学领域的研究，在基于DNA甲基化(包括亚硫酸盐测序和450k芯片数据)的肿瘤纯度估计📻、校正肿瘤纯度的差异甲基化分析及肿瘤样本聚类等问题上取得了一系列研究成果🫥。2008年至今累计发表SCI论文60余篇，包括第一或通讯作者论文40余篇，累积影响因子超过300。作为负责人承担国家自然科学基金面上项目2项，青年项目1项🧔🏼♂️，作为项目骨干承担国家重点研发计划专项1项。现任中国计算机学会生物信息专业委员会委员，中国抗癌学会肿瘤标志物专业委员会肿瘤测序及大数据分析协作组常务委员🙋🏽，中国现场统计研究会大数据统计分会理事等。
讲座简介🧑💼🔯： DNA甲基化是一类重要的表观遗传修饰，大量研究表明✊，DNA甲基化的异常与肿瘤的发生、发展都有着密切的联系🫳🏽。但临床获取的肿瘤组织中往往包含一定数量的正常细胞，因此对肿瘤组织测序得到的甲基化谱信号实际是来自正常和癌症细胞信号的组合🎆。如不加处理🚶🏻♀️，会对后续多种甲基化数据分析问题产生不利影响。因此，准确估计组织样本中肿瘤细胞的纯度，建立合适的统计模型修正肿瘤纯度对差异甲基化分析🧛🏼、肿瘤样本聚类等数据分析问题具有重要的实际意义。本次报告将介绍基于DNA甲基化Infinium450k芯片数据估计肿瘤细胞纯度的一个简单方法，并利用估计出的肿瘤纯度🧗🏻♂️🧑🦲，分别构建了差异甲基化分析和肿瘤样本聚类的两个统计学模型。
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